协议书应明确声明该兄弟自愿放弃宅基地的所有权和使用权，并同意将宅基地完全转让给另一方兄弟。
协议书中还需注明，放弃宅基地的兄弟对此没有任何异议和要求，也同意取消之前签署的宅基地协议书。
双方应在协议书上签字盖章，以此作为该项交易的有效证据。
两兄妹的孙辈算近亲。近亲是指血缘关系较近的家族成员。兄妹之间的血缘关系是直系亲属关系，他们的孙辈则是直系亲属的后代。虽然他们是通过兄妹姐弟关系连接在一起的，但孙辈与兄妹之间的血缘关系是间接的，仍然属于直系亲属。因此，两兄妹的孙辈仍然可以被视为近亲。这种近亲关系在家族中有时会对继承、权益和家族纽带等方面产生重要影响。
两兄弟共同出资自建房，可以选择在当地公证处进行公证。他们需要准备好相关的房屋自建计划书、资金拨款证明、合伙协议等相关文件，并前往公证处递交材料并进行公证。
公证处将对他们的身份和签署文件的真实性进行核实，并在文件上盖章确认，从而使自建房的合作关系得到法律的保障和认可。
公证后他们将获得一份公证书作为法律凭证。