根据最新的政策规定，从台湾地区到福建省的小三通旅客，需要提供72小时内核酸检测阴性证明。如果没有提供核酸检测阴性证明，则需要在福建口岸进行核酸检测，并在检测结果出来前进行隔离观察。具体政策可能会根据疫情情况和政策调整而有所变化，建议在出行前及时了解最新的政策规定。
2001年1月2日开通
2001年1月2日，507名马祖民众乘坐“台马轮”从马祖福澳港直航福州马尾港，“两马航线”正式开通。同日，179名金门民众乘坐“太武号”、“浯江号”客轮，从金门料罗港直航厦门和平码头，“厦金航线”首次通航。
小三通是指2001年金门、马祖、澎湖与大陆沿海的客运直航。
岛内统计显示，目前大三通由“中远之星”等3家公司经营5条航线，以去年12月来说，每周往返22个航班，每周载客量约1250人，去年12月总载客量约5000人。
小三通共有4条航线，今年1月正常航班约为每天52班，日载客约4000人，每周约364航班，停航后取消所有航班，估计每月影响约12万人。