托木尔是塔里木河的古称，也作吐木尔、托勒密、吐尔扈特。塔里木河，在维吾尔语、哈萨克语和蒙古语中，都是“托木尔”河即“流淌着金子的河”的意思。
托木斯克国立大学
托木斯克国立大学 托木斯克国立大学成立于1940年,是该市最古老、也是最著名的高校之一,是俄罗斯西伯利亚地区的重要综合性大学。该校占地面积超过2.6万平方米,拥有15个学院,包括人文学院、自然科学学院、农学与生命科学学院、工程学院等,开设了100多个本科专业和研究生课程。
托木斯克州立技术大学托木斯克州立技术大学成立于1950年,是该市的另一所重要大学,主要培养工科和技术类人才。该校设有15个学院和2个科学研究所,在机械工程、材料科学、电气工程、计算机科学等领域拥有很高的研究水平。